Gülme yeteneğini kaybetmiş genç Shinoha Tanaka, anime sevgisini paylaşan ofis çalışanı Kiwami Kimura ile tanışır. İkili birbirlerinden hoşlanırlar, ancak aslında Edo döneminden beri birbirlerini öldüren rakip güçlerin, yani ninjalar ve yakuzaların üyeleri oldukları ortaya çıkar. "Yeraltı dünyasında yaramazlık yaparsan, ninjalar seni bulur." Ninja ve yakuza... Kim hayatta kalacak, kim yok olacak?
Sekiz İmparatorluk Ninjası'ndan Kaiza Akiba'nın gelişi, ninjaların yok edilmesini planlamak için yapılan yakuza toplantısını kısa keser. Kaiza'nın Karanlığın Kılıcı, çok sayıda yakuzanın kafasını anında keser ve odayı kanla kaplar. Ancak Kiwami sakin tavrını korur ve bu da kalan yakuzaları galeyana getirir. Bu iki korkunç savaşçı öldürmeye giderken, düşünceleri başka bir yerde... Shinoha'da.
Sekiz İmparatorluk Ninjası'ndan Nodoka Matsumoto ve Sekiz Yıkım Yakuzası'ndan Kousei Yuzawa, Kabukicho'nun eski yeraltı kulübü olan Kabuchika'da savaşır. Çatışmadan kim sağ çıkacak? Nodoka'ya yardım etmek için acele eden Shinoha, genç yakuza üyesi Keisuke ile karşılaşır. Keisuke daha önce hiç kimseyi öldürmemiştir ve Shinoha onu bağışlamak ister, ancak Keisuke'nin kararlılığı Shinoha'yı zorlar.
Kabuchika olayının ardından nefretle yanıp tutuşan Shinoha ve Kiwami, spontane bir gece gezintisine çıkarlar. Flaş Prenses hakkında konuşurken birbirlerinin kayıplarını öğrenirler ve birbirlerine ilham verici bir söz verirler... Her iki tarafın karizmatik figürleri, Lanetli Kan Ninja Kardeşler ve yakuzanın bosozoku "tanrısı", kendi birliklerini toplarlar. Bu ölümcül kader savaşından kaçış yoktur!
Hayalimizi gerçekleştireceğim! "Altın çağını" geri getirmek isteyen bosozoku "tanrısı" Hiroki Yajima, 30.000 kişilik bir motosiklet çetesini kurar ve Teito Otoyolu'nu kan ve alevlerle kaplar! Ancak Zanzo ve ninjaları savaşa hazırdır ve otoyolun beş noktasında pusuya yatarak, azgın Seikaten Motosiklet Çetesi Ordusu ile yüzleşmeye hazırlanır.
Yajima, Shinoha ile oyun oynar ve Tabanca Diskosu ile kafatasını deler. Shinoha hayatıyla kumar oynar ama kıl payı kurtulur! İlk başta ninjanın gücü Yajima'yı etkiler, ancak Shinoha pişmanlıklarının onu öfkeye sürüklediğini söylediğinde Yajima sinirlenir. Shinoha'nın korkunç gücü karşısında köşeye sıkışan Yajima'nın zihninde sevgili kızının anıları belirir.
Shinoha ve Kiwami ölen arkadaşlarının yasını tutarken, Gamute annesinin yanından ayrılmaz. Hepsi öfke ve kan dökme arzusu ile yanıp tutuşur. Shiki sayesinde Shinoha, Gamute'nin özel yeteneğinin sırrını öğrenir ve kararlılığı daha da güçlenir. Bu sırada Shinoha, gizli bir şekilde Prenses Mağazası'nı ziyaret eden Başbakan Kanshichi Aida ile karşılaşır. Hikâye yeni bir dönemece girer.
Shinoha, Başbakanlık konutunda düzenlenen ödül törenine katılır. Kiwami, arkadaşıyla birlikte bu onuru kutlamak için oradadır. Ancak Cam Çocuklar aniden binayı basınca kutlama, kâbusa dönüşür. Gamute, sivillerin de dâhil olduğu ölümcül bir oyunun başladığını ilan eder ve Shinoha ile Kiwami için kader çarkları dönmeye başlar!
Bir kadının yardım çağrısını duyan Uryu, tek başına kurtarmaya koşar, ancak Ange ve Busu ile karşılaşır. Onun hareketlerini okuyabilen ikili, birleşik teknikleriyle Uryu'yu zor durumda bırakır. Ancak Uryu'nun savaşçı ruhu parıldar. Ve sonra Sako gelir...
Shinoha ve Kiwami, Ballon d'Or'a karşı güçlerini birleştirir. Gerçek kimliklerini gizlemelerine rağmen birbirlerine tamamen güvenirler. Mükemmel bir uyum içinde, rakibinin yakuza yeteneğini okur ve onun sevgili topunu yok ederler! Ballon d'Or'un öfkesi karşısında Kiwami, Shinoha'nın kaçmasını sağlamaya çalışır...
Shinoha'ya verdiği sözü yerine getirmeye kararlı olan Kiwami, içi parçalanmış olsa da Prima ile savaşır. Prima'nın yakuza yeteneğinin sadece bir illüzyon olduğunu bildiği hâlde onun tehlikeli saldırısı Kiwami'yi alt eder ve yine ağır yaralanır. Bu kargaşanın ortasında, Yuzawa'nın görüntüsü zihninde belirir...
Shinoha ve Gamute arasındaki ikinci tur karşılaşma başlar! Shinoha, Kiwami'nin tekniğini kullandığında, Gamute kendi hayatını feda ederek Shinoha'yı öldürmeye karar verir. Cehennem Kuponu'nun yasaklanmış çifte dozunu aldıktan sonra, Gamute Shinoha'ya doğru atılırken ölmüş arkadaşlarını görür.
