Sentetik Weyland-Yutani çalışanı Samuels, Amanda Ripley'e, annesi Ellen'in gemisine ait olan kara kutunun bulunduğunun ve Sevastopol İstasyonu'na götürüldüğü bilgisini verir. Kara kutuyu incelemek için bir ekip gönderildiğini ve onunda, annesinin kaderini öğrenmek için bu gruba katılma şansı olduğunu söyler.

Amanda, Sevastopol uzay istasyonunun güvenli bir sığınaktan çok uzak olduğunu keşfeder. Ayrıca istasyonda gerçekleşen mekanik arızalar ve saldırgan kolonistler tesisteki tek tehlike değildir.

Sevastopol’un gizemli katili, kayıp arkadaşlarını arayan Amanda'nın peşine düşer.

Marlow, uzaylının Sevastopol'a nasıl geldiğini açıklar ve Amanda, yaratığı avlamak için Colonial Marshal Waits ile işbirliği yapar.

Amanda, Sevastopol’un android görevlilerinin programlarının dışında hareket ettiklerini ve istasyon dışında güçlü birilerinin istasyondaki herkesin hayatını tehlikeye attığını keşfediyor.

Peşinde ki Xenomorph'dan kurtulan Amanda istasyonun kontrolünü geri almaya çalışırken korkunç gerçeği öğrenecek.

Hikaye, sonunda Amanda’nın KG-348'in yörüngesinde uzayda sürüklendiği açılış sahnesine yetişiyor. Amanda, uzaylı istilasının en büyük korkularının ötesinde olduğunu keşfeder. Artık bu cehennemden kurtulmak için tek bir şansı vardır.