Deneysel bir donanma uçağı Oahu'ya düşer. Jane Tannet ve ekibi, gizli devlet sırları açığa çıkmadan önce bunun arkasında kimin olduğunu bulmak zorundadır.

Tennant ve ekibi, bir uluslararası hırsız çetesini alt etmelidir. Bu sırada Ernie'nin sahadaki görevi beklediğinden daha endişe verici olur.

Asi çocuklara deniz piyadelerinde yeni bir yol bulmalarına yardım etmeye çalışan astsubay öldürülünce Kai, eski bir sörf çetesiyle gizli göreve gider.

Sevilen bir Hawaii kovboyu atına binerken vurulur. Jane ve ekibi suçluları bulmaya ve kovboyun hayatını korumaya çalışır.

Ekip, diplomatik bir krize sebep olabilecek cinayetin katilini bulmaya çalışır. Bu sırada kaptan Milius, Tennant'a kişisel bir istekte bulunur.

Dünyayı dolaşan bir sosyal medya yıldızı kaçırılır ve ekip, onu bulmaya çalışır.

Bir donanma astsubayı öldürüldüğünde Jane ve ekip, kurbanın arkadaşını ve meslektaşını korurken olayı araştırır.

Ekip, kapitalizm karşıtı bir protestocunun ölümünü araştırır. Jane ve kaptan Joe, bir randevuya çıkarlar.

Ekip, Pearl Harbor bombalamalarının 80. Yıldönümünde II.Dünya Savaşı döneminden kalma kemikleri içeren tüyler ürpertirici bir davayı araştırır.

Ekip, kaçak silahlarla dolu bir nakliye konteynırını araştırırken Whistler'ın ekibiyle yolları kesişir.

Bir uyuşturucu baronunu hapse atmak için gerekli olan kanıtlar çalınır. Lucy, suçluyu yakalamak için gizli göreve gider.

Ekip, bir donanma mühendisinin gizemli ölümünü araştırırken Jane'in arkadaşı kaçırılır ve olayların birbiriyle bağlantılı olduğu ortaya çıkar.

Jane, Maggie'nin kaçırılmasını araştırırken öğrendiği gerçekler karşısında şok olur ve bulgularını kanıtlayabilmek için ekipten yardım ister.

Jane, Maggie Shaw'un tutuklanmasının ardından sorgulanırken ekibin geri kalanı, gizemli bir denizci vakasını araştırıyor.

Jesse, kızı Gracie ile denizdeyken korsanlar yatlarını ele geçirir ve tüm yolcuları rehin alır. Jesse'ye saldırırlar, Gracie'yi kurtarma işi ekibe kalır.

Kai goes undercover as a chef in a local restaurant to gather intel on a notorious criminal kingpin who has a connection to the eatery. Also, Jane discovers that a school on the mainland has recruited Alex on a baseball scholarship, which he's kept secret from his family.

When a ransomware attempt causes a dam to malfunction, Ernie and a team of hackers are tasked to find the culprit quickly, before all power and water is cut off on the island. Also, Lucy and Whistler work together, giving Whistler a chance to apologize to Lucy and mend their relationship.

NCIS Agents Nick Torres and Jessica Knight travel to Hawai'i when they learn a key witness in one of their old cases has turned up there with crucial evidence.

The NCIS team investigates a shipwreck carrying exotic animals that now threaten the native wildlife on Oahu. Also, Alex sustains a career-ending injury and Kai asks Melanie, a fish and wildlife agent, out on a date.

When a navy seaman is involved in a murder, the NCIS team is called to work the case on their day off. Also, Lucy finds out Whistler turned down a promotion in D.C. to stay in Hawai'i.

Captain Milius returns to Hawai'i for a secret prisoner exchange operation and brings in Jane to be his personal security escort in the Philippines, where the exchange will take place.

Captain Milius continues to work with Tennant and her team in the aftermath of the prisoner exchange between U.S. and eastern Europe. Also, Whistler takes Ernie's advice and makes a grand gesture in the hope of winning back Lucy.