Merlin'e Büyük Ejderha tarafından genç Prens Arthur'un güvenliğini sağlamanın onun kaderi olduğu söylenir. Büyü yaparken yakalanan herkes ölümle cezalandırılır ve Merlin Arthur'un hayranı değildir. Arthur'un hayatı tehlikeye girdiğinde Merlin kendini bir sınavın içinde bulur.
Camelot yıllık kılıç turnuvasına ev sahipliği yapıyor ve diyarın dört bir yanından gelen şövalyeler gıpta edilen unvan için yarışıyor. Tacı kazanmayı umanlar arasında Şövalye Valiant da var.
Ölümcül bir veba Camelot'a yayılır. Bunun tek mantıklı açıklaması büyücülük gibi göründüğünde, Merlin ve Gaius bir tedavi bulmak için yarışırken, Gwen büyücülük yaptığı için tutuklanır ve ölüme mahkûm edilir.
Gözünü Merlin'e diken Nimueh, zehirli bir kadehten içmesi için onu kandırır ve Merlin tehlikeli bir şekilde hastalanır. Arthur panzehiri bulmak için Balor ormanının derinliklerine doğru yola çıkar, ancak bir tuzağa doğru yürüdüğünün farkında değildir
Merlin, şövalye olmayı hayal eden Lancelot adlı genç bir adam tarafından bir canavardan kurtarılır. Merlin, Lancelot'a sahte belgeler vererek Camelot'a girmesine yardım eder. Ancak canavar hâlâ serbesttir.
Leydi Morgana esrarengiz bir hastalığa yakalandığında, Gaius ne yapacağını şaşırır. Neyse ki yeni bir doktor olan Edwin Muirden, Kral'ın himayesindeki kadını uçurumun kenarından döndürmek için işe koyulur.
Morgana bir kabus görür ve Arthur'un garip ama güzel bir kızın ellerinde öldüğünü görür. Bu sırada ormanda avlanan Merlin ve Arthur, aynı kızı, Sophia'yı ve babası Aulfric'i haydutların saldırısından kurtarıp sığınmaları için Camelot'a getirirler. Morgana, Sophia'nın kâbusundaki kız olduğunu anlar ve ona vurulan Arthur'u uyarmaya çalışır. Morgana'nın gelecekteki olayları görme konusundaki sihirli yeteneği açığa çıktıkça, bir baba ve kızın sonsuz yaşam karşılığında Arthur'u feda ederek Camelot krallığını yıkma planı da ortaya çıkar.
Bir çocuğun saklanmasına yardım eden Merlin kendini Morgana ile arkadaş olurken bulur. İkili çocuğu geldiği yere geri götürmeye çalışır, ancak işler Uther'in çocuğa yardım eden herkesin idam edileceğini duyurmasıyla kötüye gider.
Uther's past comes back to haunt him as a mysterious Black Knight interrupts Arthur's coming-of-age celebrations, throwing down his gauntlet and challenging the Knights of Camelot to combat. The Black Knight, seemingly unstoppable, makes easy work of his combatants. But who is the Black Knight, and why is Uther so uneasy?
Merlin is stunned when his mother, Hunith, turns up in Camelot--bruised, battered and desperate for help from Uther. She explains to Uther that a bandit named Kanen and his men have been attacking her village demanding all of their harvest or he will kill them. When Uther refuses to help, Merlin leaves Camelot to protect his mother and friends. To Merlin's surprise, Arthur, Morgana and Gwen join forces with him to save his village--but at what cost?
Arthur brings a curse upon Camelot. Eager to help his people, he asks Anhora for advice. But is he brave enough to face the challenges ahead?
Gwen's father, Tom, helps a sorcerer named Tauren turn lead into gold using a magic stone. As Tauren escapes, Tom is caught and will await trial. Whilst looking for Gwen, Morgana finds the magic stone, and Merlin can sense it. When Tom is killed by Uther, Morgana is out for revenge on Uther.
On a hunting trip, Arthur comes face to face with a creature of great power from the old religion. When Gaius informs them that it can only be killed by magic, Uther refuses to listen and sends out his knights to kill it. Arthur is fatally wounded and Merlin must go to the Isle of the Blessed to save him. But will he be able to pay the price?
