Altıncı sezonun birinci bölümünde Chicago Med'in tüm çalışanları pandemiye alışmaya çalışıyor. Dr. Choi, Dr. Lanik ve April ön cephede savaşıyor. Dr. Halstead ve Hannah rahatsız edici bir gerçekle yüzleşiyor. Dr. Charles yaşanan son olaylardan sonra kızıyla arasını düzeltmeye çalışıyor.
Goodwin, Acil'e yeni Şef atar ve bu seçim herkesi mutlu etmez. Dr. Manning hastasının safını tutar ve kendini sonuçlarıyla uğraşırken bulur. Dr. Charles aile işleriyle meşguldür.
Dr. Charles ve April, acil servisteki gizemli bir hastayla ilgilenirler. Dr. Halstead ise deneydeki hastalarından biri hakkında ölüm kalım kararı vermek zorunda kalır. Dr. Marcel, acil servise gelen bir tanıdığı sayesinde geçmişiyle yüzleşir.
Dr. Marcel ve Dr. Manning, hasta bir kadına yardımcı olabilmek için her şeylerini ortaya koyarlar. Dr. Halstead ise yürüttüğü deney için örneklem bulmakta güçlük çeker. Öte yandan, Dr. Choi, kendini mükemmelleştirmeye çalışan bir hastayla cebelleşir.
Dr. Marcel ve Dr. Manning, hasta bir kadına yardımcı olabilmek için her şeylerini ortaya koyarlar. Dr. Halstead ise yürüttüğü deney için örneklem bulmakta güçlük çeker. Öte yandan, Dr. Choi, kendini mükemmelleştirmeye çalışan bir hastayla cebelleşir.
Dr. Halstead deneyinde sürekli bir başarı sağlıyor. Dr. Charles'ın kızı, Anna, çok önemli bir haber alıyor. Noah kendini April'ın bile düzeltemeyeceği bir durumda buluyor.
Deneydeki hastalardan biri rahatsızlanınca Will'in başı belaya girer. Ethan ise kendi stresi ve semptomları nedeniyle çalışmakta zorlanır.
Ethan, Deniz Kuvvetlerindeki eski bir meslektaşını acilde işe alır. Yapılan son duruşma ise Dr. Charles ve kızını tamamen ayrılmanın eşiğine getirir. Öte yandan, Maggie, Auggie'nin hayatını değiştirecek bir seçim yapmak zorunda kalır.
Maggie kendi travmasıyla uğraşırken, ihtiyacı olan bir anneye yardım ediyor. Dean birden fazla doktorla ortalığı karıştırmaya devam ediyor. Acil tedaviye ihtiyacı olan bir hasta Med'e geliyor ama onların tedavi etmesini istemiyor.
Crockett sandığından daha çok ortak noktası olduğu bir hastayla ilgilenir. Will ve Ethan kalp ritmi düzensiz olan bir hamile hasta için karşı karşıya gelir.
Ethan, kariyerinin sona ermesinden korkan bir tenis oyuncusunun tedavisi için, beklenmedik biriyle birlikte çalışır. Goodwin'in yeni protokolleri, çalkantılara yol açar.
Dean ve Ethan, kendilerini geçmişteki kötü anıları anımsatan bir vakanın ortasında bulurlar. Carol'un durumu kötüleşmeye başlayınca Natalie, annesine iyi gelebilecek her yolu denemeye koyulur.
Goodwin bir çocuk ve annesine yardım etmeye çalışırken bir araba kazası onu çıkmaza sokuyor. Natalie'nin gizli tavırları Dr. Marcel ve Dr. Halstead'in dikkatini çekiyor.
Üçüncü sınıf tıp öğrencileri acilde rotasyonlarına başlarlar ve Maggie içlerinden birine çok dikkat eder. Annesinin sağlığı kötüye giden Natalie onu tedavi etmek için ihlal ettiği kuralların üzerini örtmeye çalışır.
Kısa süre önce nakil yapılan bir hasta, komplikasyonlarla dönünce Crockett, ameliyatta bir hata yapmış olduğunu düşünür. Carol, yine hastalanınca Will ile Natalie, hatalarını düzeltmek için bir şeyler yapmak zorunda kalır.
Yeni bir kalp bulununca, Carol yeniden yaşama fırsatı elde eder. Ethan ve Dean eskiden kalma bir sabırla kendilerini belanın içinde bulurlar. Will ise çalınan deney ilaçlarının sorumluluğunu omuzlar.
