Сумасшедший ученый Окабе сдается после неудачной попытки спасти Курису и погружает свою полную жизни личность в пыльные страницы прошлого. Он больше не тот "Хооуин Кёма", которого мы знаем. Когда все становится нормальным, он встречает Кирусу, которая говорит, что начала тестировать устройство, хранящее память человека, и создает симуляцию с персонажами и личностями. Окабе также начинает тест и сталкивается с неожиданными трагедиями, которые приносит симуляция Курисы. "Zero" — это побочная история, которая помогает осуществить оригинальный сюжет и исследует будущее Beta Attractor Field.