Ölmekte olan annesini kurtarmak için Mulder, dünya dışı bir şifacı olan Jeremiah Smith'i acımasız bir uzaylı kelle avcısından korumalıdır.

Küçük ve barışçıl bir kasabada, ajanlar rahatsız edici doğum kusurları olan bir bebeğin ölümünü araştırır ve ipuçları onları akraba evliliği yapan, genetik mutantların bulunduğu bir klana götürür.

Birkaç siyah adam vücutları tamamen cilt pigmentasyonundan yoksun ve ölü olarak bulunduğunda Mulder ve Scully, hayatta kalmak için insan hormonlarını tüketmesi gereken Afrikalı bir katilin peşine düşer.

Mulder ve Scully, acımasız bir katili yakalamak onun farkında olmadan geride bıraktığı en karanlık fantezilerini ve korkularını ortaya çıkaran psişik fotoğrafları deşifre etmeye çalışırlar.

Dini bir tarikatı incelerken, Mulder önceki yaşamından tanıyor olabileceği bir kadınla karşılaşır.

Prestijli bir hastanede bir dizi cinayet, Mulder ve Scully'yi kara büyü yoluyla kendi hayatını uzatmaya çalışan plastik bir cerrahın peşine düşürür.

Mulder ve Scully’nin gizemli düşmanları, JFK suikastının ve 51. Bölge'nin meşhur UFO örtbasının ardındaki gerçeği ortaya çıkarır.

Esrarengiz bir kayanın içinde ölümcül, yapışkan bir organizma bulunduğunda, ajanlar kayanın kökenini belirlemek için işe koyulur.

Kayanın içindeki organizmanın yabancı bir varlık olduğuna dair somut bir kanıt elde etmek için Mulder, iki yüzlü Krycek ile güçlerini birleştirir ve hilekarlıklarının altınla yatan şaşırtıcı şeylerle yüz yüze gelir.

Kehanetvari rüyalar, Mulder'ı bir seti katilin keşfedilmemeiş kurbanlarını aramaya yönlendirir. Mulder, aralarından birinin kayıp kız kardeşi Samantha olabileceğini öğrenir.

Meksikalı bir göçmen kampında bir dizi paranormal ölüm meydana geldikten sonra, Mulder ve Scully “El Chupacabra” olarak bilinen efsanevi kan emici bir yaratığın peşine düşer.

Başı kesilmiş bir sağlık görevlisinin vücudu görünüşte hayata döndüğünde, ajanlar, bu insanın rejenerasyon yapabilen evrimsel bir yaratık olabileceğinden şüphelenmeye başlar.

Hayatı hakkında hayal kırıklığına uğradığını hisseden Scully, kıskanç dövmesinin onu karşılaştığı kadınları öldürmeye zorlayan tehlikeli bir yabancıyla çıkmaya başlar.

Scully, ameliyat edilemeyen kanseri ile barışmaya çalışırken, Mulder ve Lone Gunmen, onun hayatını kurtarabilecek tedaviyi bulmak için yüksek güvenlikli bir araştırma laboratuvarına girer.

Ajanlar, Hasidik bir Yahudi cemaatindeki nefret suçunu soruştururken ölü bir adam tarafından işlenmiş gibi görünen bir cinayeti ortaya çıkarır.

Ordu görevlilerin görünmeyen bir suikastçı tarafından öldürülmesini durdurmak için, Mulder ve Scully kendisini kurbanlarına görünmez kılabilen, hayata küsmüş bir Vietnam gazisini yakalamalıdır.

Ticari bir uçağın açıklanamayan kazası hakkında cevap arayan ajanlar, kendilerini ıssız bir gölün dibinde şaşırtıcı bir keşfin içinde bulur.

Mulder ve Scully, talihsiz uçaktaki yolcuların, bir uzaylı teknolojisi peşindeki ordu tarafından kasıtlı bir şekilde feda edildiğini ortaya çıkarmak için kolları sıvar.

Birkaç araştırmacı bilim insanı donarak öldüğünde, Mulder ve Scully, cinayetlerin arkasında gelecekten gelen bir zaman yolcusunun olabileceğinden şüphelenir.

Küçük bir kasabada vestijyal kuyruklarla doğan bebeklerinin gerçek babasının, Mulder da dahil olmak üzere herkesi taklit edebilen bukalemun benzeri bir adam olduğu ortaya çıkar.

Scully'nin hayatını kurtarmak için bir anlaşma yapan Skinner, Sigara İçen Adam'ın ölümcül bir arı saldırısındaki kanıtları yok etmesine yardımcı olur. Fakat aslında kendini bir cinayet tezgahında bulur.

Kadın kurbanların hayalet görüntüleri cinayet mahallilerinin yakınında göründüğünde, Mulder ve Scully bu hayaletlerin, onları görenler için ölüm habercisi olabileceği sonucuna varırlar.

Kan revan içinde ve unutkanlık yaşayan Mulder, som birkaç günün olaylarını bir araya getirir. Ancak bulunan izler, Mulder'ın silahıyla işlenmiş çifte cinayete çıkar.

Mulder, Kanada dağlarında donmuş bir şekilde keşfedilen şeyin uzaylı yaşamının reddedilemez bir kanıtı olduğunu kanıtlamak için savaşır, ancak gerçek arayışı sadece daha fazla yalan ve öngörülemez bir sonuca yol açar.