Ryo Takatsuki descubre que su brazo derecho desaparecido es en realidad un implante de nanomáquinas ARMS de experimentos genéticos secretos, y junto a sus compañeros de pruebas Kei Karuma, Takeshi Tomoe y Hayato Shingu, lucha contra los creadores de la tecnología, los Egrigori, para rescatar a su novia secuestrada, Katsumi Akagi.
