'House of the Dragon' 2. sezonu, Rhaenyra (Emma D'Arcy) ve Aegon (Tom Glynn-Carney) arasındaki taht mücadelesinin giderek şiddetlendiği bir döneme işaret ediyor. İkinci sezon, siyasi bölünmelerden tam anlamıyla ejderha savaşlarına geçiş yaparak, karakterlerin ne kadar acımasız olabileceklerini gözler önüne seriyor. Rhaenyra, babası tarafından varis olarak atanmışken, yeminlerine sadık kalacak müttefikler arıyor. Aegon ise Batıros'un ataerkil toplumuna güveniyor. Ancak savaş kaçınılmaz ve ejderhalar savaştığında kimse güvende değil.

Birinci sezonun sonunda Rhaenyra'nın ikinci oğlunun ölüm haberini almasının ardından, Rhaenyra, Lucerys'in (Elliot Grihault) kalıntılarını bulmak için ejderhasıyla yola çıkıyor. Ancak, yas tutacak pek bir şey bulamıyor. Bu sırada, Jacaerys (Harry Collett) kardeşinin ölüm haberini alarak müttefikler arayışına devam ediyor. Eve döndüğünde, hem Stark hem de Arryn hanedanlarının Rhaenyra'yı destekleyeceğini doğruluyor. King's Landing'de ise Yeşiller farklı bir kaosla yüzleşiyor. Alicent (Olivia Cooke), Aegon'un içgüdülerini dengelemeye çalışırken, barış umudunu korumaya çalışıyor. Ancak, King's Landing'i tehdit eden bir ablukayla birlikte, Aemond (Ewan Mitchell) ve Aegon savaş için hazır durumda.

Daemon (Matt Smith), harekete geçmekte kararlı bir şekilde Mysaria'dan (Sonoya Mizuno) yardım alıyor. Mysaria, Dragonstone'a gizlice gelmişken, ona özgürlüğü karşılığında intikam planı yapmasına yardımcı oluyor. King's Landing'e sızan Daemon, Şehir Gözcüsü'nden birini ve bir kaleye fare avcısını işe alarak tünellerden geçip Aemond'u öldürmeye çalışıyor, ancak Aemond evde yok. Bunun yerine, iki adam Aegon'un küçük oğlu Jaehaerys'i öldürüyor ve Helaena'yı (Phia Saban) zor durumda bırakıyor. Bu trajedinin ardından Otto, durumu kendi lehine çevirerek Rhaenyra'yı suçluyor ve kamuoyunu ona karşı kışkırtıyor. Aegon, sorumluları bulmak için Larys Strong'dan (Matthew Needham) yardım alıyor ve sonuçta, Aegon, Goldcloak'ı öldürse de diğerini bulamayınca şehrin tüm fare avcılarını idam ettiriyor. Otto, Aegon ile bu konuda yüzleştiğinde, Aegon, büyükbabası Otto'yu Kralın Elinden alarak Criston ile değiştiriyor. Rhaenyra, Daemon'un trajedideki rolünü keşfettiğinde ise aralarında bir tartışma çıkıyor.