تم تطوير الطاقة الفائقة، طاقة الفوتون، من خام اليابانيوم. يسعى الدكتور هيل، المجنون الذي يتوق إلى الهيمنة على العالم، مع مرؤوسيه بارون أشورا والكونت بروكن، إلى قيادة الوحوش الآلية المستخرجة من جزيرة بارودوس (التي يُعتقد أنها رودس) للهجوم على مختبر طاقة الفوتون وأخذها لنفسه. يواجه هجومهم بجرأة بطلنا، المراهق الحار الدم كوجي كابوتو الذي يقود الروبوت الفائق مازينجر زد، الذي بناه جده جوزو والمصنوع من أقوى معدن، تشوجوكين زد. لكن في هذه المعركة بين الدكتور هيل وعائلة كابوتو، تبقى العديد من الأساطير المحيطة بالحضارة الميسينية وجزيرة بارودوس، بالإضافة إلى أسرار مازينجر زد، غامضة.
